Doin éditeurs
Éditions John Libbey Eurotext
30, rue Berthollet
94110 Arcueil
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e-mail : contact@jle.com
http://www.jle.com
www.librairiemedicale.com

John Libbey Eurotext Limited
34 Anyards Road, Cobham
Surrey KT11 2LA
United Kingdom

© Éditions John Libbey Eurotext, 2023

ISBN : 978-2-7040-1732-4

Table des matières

Page de titre

Page de copyright

Préfaces

Auteur, autrices

Partie I. Pour bien commencer

1 - L'éthique en recherche - Chez l'être humain

Déontologie et éthique dans le soin

Éthique de la recherche sur l'être humain

La réglementation en France

Mener une recherche en France : les points cardinaux

Focus sur l'information et le consentement du patient

2 - La protection et la gestion - Des données de recherche

Information et consentement dans le cadre de la recherche

Droits du patient

Quelles démarches pour l'utilisation des données

La sécurité

La gestion des données

Le monitoring

Anonymisation et pseudonymisation

3 - Vers une recherche responsable - Et intègre

La situation en France

Enregistrer tous les protocoles

Publier tous les résultats

Partager les données (datasharing)

Impliquer le patient à différentes étapes de la recherche

Prendre en compte la diversité

Respecter les règles d'autorat

Respecter les droits de propriété et éviter les pratiques douteuses

Déclarer les liens et conflits d'intérêt

4 - La littérature en santé : - Recherche et évaluation

La recherche d'information

La sélection des articles à partir des listes des bases documentaires

La lecture critique des articles

5 - Concevoir une recherche

Médecine rationnelle et niveaux de preuve

Délimiter une recherche biomédicale

Choisir une méthode adaptée à la question

6 - Écrire en science : le style

Le meilleur style est l'absence de style

Penser aux lecteurs

La précision est la première qualité d'un article scientifique

La clarté permet d'être lu et compris

La brièveté est la troisième qualité d'un article scientifique

Partie II. L'Article de recherche

7 - Le plan de l'article de recherche

Le compte-rendu de recherche

Le plan dans le domaine biomédical

Les variantes de l'IMRaD

Le plan pour une recherche qualitative

La page de titre / page de garde

Autres éléments

8 - L'introduction

Pourquoi ai-je fait ce travail ?

Les trois sections d'une introduction : un entonnoir

Questions autour de l'introduction

9 - Les « méthodes »

Comment ai-je fait ce travail ?

Les différentes sections du chapitre « Méthodes »

Questions autour des méthodes

10 - Les résultats

Qu'est-ce que j'ai observé ?

Un équilibre entre texte et illustrations

Texte et illustrations ne doivent pas être redondants

Chaque tableau, chaque figure doivent être compris sans lire le texte

Le diagramme de flux (ou flow chart)

Les données manquantes

11 - La discussion

Qu'est-ce que j'en pense ?

Les sections de la discussion

Questions autour de la discussion

12 - Tableaux et figures

Deux types d'illustrations

Les tableaux

Les figures

13 - Les sources et références

Place des références

Sélection des références

Les articles originaux sont cités en priorité

Utiliser le système de références choisi par le journal ciblé

Les logiciels pour gérer les références

Quelles sont les documents qui ne doivent être cités qu'en dernier recours ?

Un quart des références ne contiennent pas les données attendues

14 - Le titre

Trois options pour le titre d'un article original

Ni trop long, ni trop court

Le propos : quelle information donner ?

Le choix des mots, la formulation

15 - Le résumé et autres éléments - De synthèse

Le résumé textuel

Points clés et résumé visuel

Partie III. La thèse, le cas clinique

16 - Faire une thèse de doctorat ou d'exercice

Initiation à la recherche en santé

Démarches administratives

Le thème et le directeur de thèse

Le planning et les moyens

17 - Rédiger et valoriser sa thèse

Apprendre à écrire

Une recherche intègre

La soutenance

Après la soutenance de la thèse

18 - Étude de cas : le cas clinique original

Quel est le plan du cas clinique original ?

Une description factuelle et chronologique de l'observation

Une discussion courte et bien faite est informative

La série de cas

Les auteurs d'un cas clinique

Les lignes directrices CARE (CAse REports)

Les journaux spécialisés sur les cas : exemple du BMJ Case Reports

Les études de cas suivies d'une revue de la littérature

Les autorisations des patients

19 - Étude de cas : le cas clinique - Pour l'enseignement

La vignette clinique

Le cas pour dérouler un raisonnement clinique

Le récit de situation clinique authentique

Le test de concordance de scripts

Partie IV. Autres types de recherches

20 - La revue de la littérature

Les revues générales dites « narratives »

Les revues systématiques

Les différentes revues systématiques

Choisir la bonne revue de la littérature

Les sociétés de rédaction

La qualité des revues de la littérature

21 - La recherche qualitative en santé

Les journaux STM versus SHS

Où publier une recherche qualitative en santé ?

Plan des articles de recherche qualitative en santé

22 - L'essai clinique

Rédiger et publier le protocole

Rédiger le rapport clinique

Les bonnes pratiques de publication

La publication des résultats

23 - Les autres formats de publication

L'éditorial

Les communications courtes

Les data papers

Les revues de la littérature et articles pédagogiques

Les correspondances

Les analyses commentées

Les recommandations de pratique clinique

Les vidéos en chirurgie

Les livres

Les articles écrits par des journalistes dans des journaux scientifiques

Partie V. Écrire et publier en pratique

24 - De la soumission à la publication : connaître les journaux

Étape 1 : le choix du journal

Étape 2 : la soumission de l'article à un journal

Étape 3 : la sélection des articles par le comité de rédaction

Étape 4 : la soumission de la révision au journal

Étape 5 : la version of record : préparation du document final et épreuves

Le fonctionnement d'un journal

25 - Le peer review

Qu'est-ce que le peer review ?

La réponse des auteurs au rédacteur en chef

Les autres modèles de peer review

26 - Les auteurs d'une publication - Scientifique

La qualité d'auteur : critères ICMJE

L'ordre des auteurs

L'auteur de correspondance

Les affiliations

Le numéro ORCID® iD de chaque auteur

Les auteurs multiples : comment optimiser le travail d'équipe ?

Les contributeurs et la taxonomie CRediT

Les remerciements

La déclaration des liens d'intérêt

Les rédacteurs médicaux (medical writers)

Les auteurs honorifiques et auteurs fantômes

L'intelligence artificielle pour écrire les articles

Cas particuliers : consortium, décès, pays en développement

27 - Les instructions pour les auteurs

Les recommandations ICMJE, un texte fondateur

EQUATOR : plus de 500 lignes directrices

Les instructions des journaux

Les lignes directrices SAGER pour le sexe et le genre

Les lignes directrices SAMPL pour les statistiques

Les corrections, mises en garde, rétractations

Les sociétés savantes de rédacteurs et d'éditeurs

28 - La mise en forme d'un article

Les nomenclatures et classifications

Le bon usage du « etc. »

Les abréviations

La ponctuation

L'orthographe, la grammaire et la typographie

La dactylographie des nombres, les pourcentages

Le langage inclusif

Le DOI (Digital Object Identifier)

Les licences Creative Commons

29 - Les journaux des professions de santé - En langue française

Utilisation des journaux par les professionnels de santé

Les journaux bilingues

L'attirance vers les journaux anglais

L'isolement linguistique de certains chercheurs

Les bonnes pratiques et critères de qualité de la presse médicale française

Partie VI. Bien communiquer et être visible

30 - L'abstract pour un congrès

Comment choisir le congrès pour soumettre un abstract ?

Écrire et soumettre un abstract

Modalités de soumission et de sélection

31 - La communication affichée ou poster - Pour un congrès

Les formats numériques : e-posters

Contenu du poster

La forme du poster

Des posters simplifiés : une phrase de conclusion mise en exergue

Logistique autour du poster

Le poster commenté

Après le congrès

32 - La communication orale

Les modèles de communication orale des professionnels de santé

Préparer la rencontre avec le public

Pour préparer votre communication…

Trois messages répétés trois fois

Parler en public s'apprend

Les supports visuels : simplicité, clarté et concision

33 - Accès ouvert, preprints - Et archives ouvertes

Une taxonomie de la science ouverte

La publication en accès ouvert

Les preprints

Les archives ouvertes

34 - Les journaux prédateurs, - Conséquence du modèle auteur-payeur

Le modèle auteur-payeur remplace le modèle lecteur-payeur

La naissance des journaux prédateurs

Définition et fonctionnement d'un journal prédateur

Des listes blanches et noires de journaux prédateurs

Comment éviter les journaux prédateurs ?

Entre les journaux légitimes et les prédateurs : les journaux de faible qualité

Les journaux légitimes non efficients

35 - Augmenter la visibilité - Des recherches

Communiquer pour ses pairs

Communiquer pour le citoyen averti

Communiquer pour les journalistes et décideurs

Post-face le chercheur, l'auteur, - Le médecin et le patient

Pour en savoir plus

ICMJE : extraits des recommandations

Index

Préfaces

« Selon que notre idée est plus ou moins obscure,

L’expression la suit, ou moins nette, ou plus pure.

Ce que l’on conçoit bien s’énonce clairement,

Et les mots pour le dire arrivent aisément. »

(Nicolas Boileau, Art poétique, Chant I, v. 147-207)

La recherche en santé est indissociable de la pratique clinique ; elle contribue aux progrès de la science, à l’amélioration de la santé, mais aussi de façon déterminante à la qualité des soins et du service rendu aux patients ainsi qu’à la qualité de l’enseignement des étudiants.

Elle repose sur un questionnement personnel, indépendant du domaine des connaissances explorées, fait d’étonnement, de curiosité ; une rigueur méthodologique expérimentale, un respect des règles éthiques et d’intégrité scientifique conduisent à sa concrétisation par la publication des travaux réalisés.

La publication est une étape importante dans la reconnaissance et la valorisation de la recherche. Elle nécessite le respect de règles rédactionnelles afin de permettre au plus grand nombre de comprendre la signification des travaux au-delà du domaine d’expertise propre au lecteur. Tout l’enjeu pour celui ou celle qui rédige pour la première fois un article scientifique sera donc d’acquérir ce « savoir-écrire ».

Ce « savoir-écrire » scientifique est un exercice minimaliste : écrire sans style avec un nombre de mots limités, mais bien choisis pour décrire le plus clairement possible les travaux réalisés, leur interprétation et les perspectives offertes. Il doit également obéir aux règles propres à chaque type de manuscrit : article de recherche, de vulgarisation scientifique, revue de la littérature, thèse, lettre à l’éditeur, cas clinique.

La rédaction scientifique doit obéir à des règles éthiques et d’intégrité scientifique propres, relatives au respect des conditions de réalisation de l’étude, du rang et de la contribution respective des auteurs ; de l’originalité et de la véracité des données, de l’absence de plagiat. Quand le travail réalisé a concerné des patients, il doit répond aux règles de la recherche clinique et à l’éthique de la pratique médicale. Toute nouvelle publication doit faire référence aux travaux antérieurs du domaine de connaissances en recherchant toutes les publications, y compris celles n’ayant pas de format numérique et celles écrites dans d’autres langues que celles de l’auteur. Le journal choisi pour publier sa recherche doit être choisi en fonction de la cible de diffusion souhaitée, en évitant les journaux dits « prédateurs » dont l’objectif mercantile n’est pas compatible avec la recherche d’une production scientifique de qualité.

Tous ces aspects et bien d’autres sont abordés dans cet ouvrage conçu pour aider celui ou celle qui se retrouve pour la première fois devant l’écran blanc de son ordinateur ou sa page blanche pour rédiger son premier article scientifique.

Pr Benoît Veber
Président de la Conférence des doyens de médecine
Doyen de la Faculté de médecine de Rouen
Pr Gilles Rode
Doyen de la Faculté de Médecine Lyon-Est

Cet ouvrage est simple.

Il est composé de courts chapitres structurés et informatifs construits comme des fiches. Il se lit rapidement, d’une seule traite ou par fiche en fonction de l’intérêt du moment.

Mais que l’on ne s’y trompe pas, ces fiches sont également très précises et leur précision émane d’une vraie profondeur de réflexion.

« Ouvrage simple et rapide à lire » et « grande réflexion » sont des qualités en apparence oxymoriques et qui, pourtant, apportent une vraie puissance à ce document. Il sera donc UTILE. Utile au jeune chercheur qui se lance dans ses premières productions écrites, utile au chercheur sénior pour avoir des fondamentaux en enseignement, utile au jeune médecin pour sa thèse ou ses publications émanant de ses travaux.

Mais soyons clair, cet ouvrage est également recommandé à tous les professionnels du soin qui se lancent dans la recherche et qui sauront mieux ajuster leurs productions écrites ; recommandé aux collègues infirmiers qui approuveront la posture pluriprofessionnelle, pluridisciplinaire et surtout pluri-méthodologique de l’auteur et des autrices qui prônent clairement la recherche mixte en prodiguant des conseils pour les recherches qualitatives pour exemple. Ce recueil de fiches leur sera un indispensable.

Alors quand doit-on commencer et prévoir la rédaction d’un article ? Quel style doit-on adopter ? Qu’est-ce qu’une recherche responsable ? Autant de questions élémentaires mais peu traitées pour lesquelles le lecteur trouvera une réponse dans cet ouvrage.

Ces fiches sont aussi un fondement aux questionnements beaucoup lus dans les réseaux sociaux. Écrire dans un journal scientifique ou professionnel ? Ce journal est-il indexé ou un journal prédateur ? Il ne nous appartient pas de répondre dans ces lignes, mais chacun pourra trouver matière à réflexion dans cet ouvrage et ajuster ses réponses non pas sur des idées mais sur des éléments probants.

L’auteur principal de cet ouvrage (et auteur de La rédaction médicale) est un être inclassable, curieux et enthousiaste avec une véritable passion pour le savoir et la transmission des savoirs. Sa trajectoire est foisonnante et suscite toute mon admiration.

Pr Monique Rothan-Tondeur
Directrice de la chaire Recherche sciences infirmières,
Laboratoire Éducations et promotion de la santé,
Bobigny, Université Sorbonne Paris Nord

Auteur, autrices

Hervé Maisonneuve, ancien interne et ancien assistant des Hospices civils de Lyon (1975) et diplômé MBA/HEC (Paris, 1994) a été professeur associé de santé publique (Paris 7 et Paris-Sud 11). Il a pratiqué la médecine pendant 10 ans (maladies infectieuses et tropicales), puis a été responsable de développements cliniques de 1983 à 1994 (Duphar, Pasteur-Mérieux). Il a été directeur de l’évaluation de l’Agence nationale d’accréditation et d’évaluation en santé (ANAES) jusqu’en 1999 puis consultant (Cambridge, UK), avant de développer des formations en ligne pour chirurgiens (Strasbourg, www.websurg.com). En 2005, il a dirigé un département de formation médicale continue et médias scientifiques (Pfizer). De 2009 à 2013, il a animé des formations (DIU) dans le cadre du plan Alzheimer. Depuis 2009, il a une activité de conseil et de formation en rédaction et intégrité scientifiques, au sein d’une SARL (H2MW). D’octobre 2019 à septembre 2022, il a été référent intégrité des facultés de médecine Paris 7, Université de Paris. Il a participé à des comités de rédaction de journaux scientifiques, a été président de European Association of Science Editors (1994-1997) et rédacteur en chef de European Science Editing. Il est rédacteur du blog Revues et Intégrité (www.redactionmedicale.fr).

https://orcid.org/0000-0001-8365-7558

Marie-Ève Rougé-Bugat, médecin généraliste depuis 2009, exerçant à Toulouse dans une maison de santé pluriprofessionnelle universitaire, professeure en médecine générale depuis 2017, titulaire d’un DESC en oncologie (2010). Ses travaux d’enseignement et de recherche sont dirigés vers le parcours de soins des patients atteints de cancer. Elle appartient à l’unité mixte de recherche Inserm et Université Paul Sabatier CERPOP « Centre d’épidémiologie et de recherche en santé des populations », UMR 1295 au sein de l’équipe 5. Elle obtenu la prime d’encadrement doctoral et de recherche en 2018. Elle a participé à des comités de rédaction de journaux scientifiques notamment de 2016 à 2019 (European Journal of General Practice). Elle est depuis 2019, rédacteur associé pour le journal La Presse Médicale Open. Elle est intervenue dans plusieurs travaux avec l’INCa (Institut national du cancer) depuis 2010. Elle fait partie du comité Éthique et cancer de la Ligue contre le cancer depuis 2019. Elle a des responsabilités au sein des conseils pédagogiques et des facultés de médecine de Toulouse depuis 2012 et est élue au département de médecine, maïeutique et paramédical de la faculté santé de Toulouse depuis 2022. Elle est membre de la sous-section 53-01 du CNU (collège national des universités).

https://orcid.org/0000-0002-3562-5815

Évelyne Decullier a obtenu son doctorat « Statistiques et santé » en 2005 à l’Université Lyon 1 pour un travail sur le devenir des protocoles de recherche clinique. En poste depuis 2001 aux Hospices civils de Lyon, elle accompagne les chercheurs de l’institution de l’idée de recherche jusqu’à la publication grâce à sa formation initiale en statistiques et épidémiologie et son expérience acquise sur le terrain. Elle mène ses propres recherches dont les thématiques sont notamment le biais de publication, le statut d’auteur, les rétractations, les affiliations, les conflits d’intérêt et les liens entre le genre et la méconduite. Elle participe au groupe de travail « Déclaration de partage des données issues des essais cliniques » du ministère de l’Enseignement supérieur, de la recherche et de l’innovation. Résolument tournée vers la dimension humaine de la recherche, elle est membre d’un comité de protection des personnes depuis 2006 et a été nommée en 2023 à la Commission nationale des recherches impliquant la personne humaine (CNRIPH). Elle est en charge de développer la recherche paramédicale dans son institution et officie dans le jury national du Programme hospitalier de recherche infirmière et paramédicale. Depuis 2022, elle est membre du conseil d’orientation de l’Office français de l’intégrité scientifique (COFIS).

https://orcid.org/0000-0002-2412-4767

Nous remercions les participants à nos séminaires : par leurs questionnements, ils nous ont incités à nous former en permanence. Nous remercions nos collègues qui ont préfacé ce livre, Gérard Reach, Gilles Rode, Monique Rothan-Tondeur, Benoît Veber.

Sans pouvoir tous les citer, nous remercions nos collègues qui nous ont accompagnés dans nos démarches pour enseigner la rédaction scientifique et les principes d’une recherche responsable, en particulier Philippe Amouyel, Emmanuel Hirsch, Joël Ménard, Stéphane Oustric.

Nous remercions nos collègues ayant participé aux éditions successives de La rédaction médicale depuis 1990, en particulier Gérard Lorette et Annabel Maruani, ainsi que les personnes de Doin qui nous ont accompagnés, en particulier Peggy Lemaire et Maud Thévenin.

Nous remercions tous nos collègues investis dans l’encadrement des étudiants dans leurs travaux de recherche, la publication et la communication de ces travaux.